Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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