Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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