Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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