Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CACNA1SQ13698 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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