Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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