Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms