Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SMTNP53814 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SMTNP53814 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms