Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TMPOP42166 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMPOP42166 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMPOP42166 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms