Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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