Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PFDN4Q9NQP4 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms