Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGF29Q96ES7 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SGF29Q96ES7 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms