Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms