Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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