Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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