Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDX39BQ13838 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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