Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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