Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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CUL1Q13616 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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