Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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