Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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GPS1Q13098 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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GPS1Q13098 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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GPS1Q13098 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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