Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ACACAQ13085 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms