Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TSPAN31Q12999 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms