Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms