Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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