Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms