Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPRMP28827 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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PTPRMP28827 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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PTPRMP28827 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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PTPRMP28827 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTPRMP28827 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRMP28827 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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