Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMNB1P20700 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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