Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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