Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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