Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms