Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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