Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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