Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RXFP2-202ENST00000380314 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GMFG-204ENST00000595636 487 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms