Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
AP3B2Q13367 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms