Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms