Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TTPAP49638 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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TTPAP49638 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TTPAP49638 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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TTPAP49638 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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