Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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