Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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USP18Q9UMW8 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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