Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TM6SF1Q9BZW5 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms