Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms