Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms