Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ITGA7Q13683 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ITGA7Q13683 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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