Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL3Q13618 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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