Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXE3Q13461 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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