Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms