Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SRSF5Q13243 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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