Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms