Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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