Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CENPFP49454 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms