Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms