Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms